Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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