Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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HOXD10P28358 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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