Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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