Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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