Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MIS18AQ9NYP9 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms