Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP21-1Q3LI58 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms