Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL24A1Q17RW2 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL24A1Q17RW2 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL24A1Q17RW2 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL24A1Q17RW2 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL24A1Q17RW2 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL24A1Q17RW2 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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