Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms