Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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