Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FHL3Q13643 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms