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| FHL3 | Q13643 | AL928596.1-201 | ENST00000636738 | 632 nt | TSL 2 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | ZNF532-201 | ENST00000336078 | 6696 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTTP-203 | ENST00000457717 | 4092 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | THEMIS-204 | ENST00000537166 | 3830 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC072062.1-210 | ENST00000628464 | 1315 nt | TSL 5 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | ECM2-202 | ENST00000375540 | 1606 nt | TSL 2 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | CD47-201 | ENST00000355354 | 5020 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | TANC2-202 | ENST00000424789 | 11721 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | CLEC4D-201 | ENST00000299665 | 1936 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF436-201 | ENST00000314011 | 4071 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | AIG1-208 | ENST00000494282 | 3393 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | GTDC1-206 | ENST00000409214 | 2954 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | KCNA2-209 | ENST00000639048 | 10836 nt | TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORD1C-201 | ENST00000363315 | 78 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-878P-201 | ENST00000384578 | 110 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | HIST1H3PS1-201 | ENST00000404612 | 417 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | FLJ27354-201 | ENST00000415584 | 788 nt | TSL 2 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC004946.1-201 | ENST00000421825 | 751 nt | TSL 3 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | SLC44A3-AS1-205 | ENST00000424505 | 612 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL590399.2-201 | ENST00000427536 | 309 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC01884-201 | ENST00000433429 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AL163192.1-201 | ENST00000448858 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC092608.1-201 | ENST00000503505 | 267 nt | TSL 2 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC108475.1-201 | ENST00000507880 | 950 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC107398.2-201 | ENST00000508081 | 601 nt | TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |