Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTCH1Q13635 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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