Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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