Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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