Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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SEMA3BQ13214 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SEMA3BQ13214 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SEMA3BQ13214 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SEMA3BQ13214 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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SEMA3BQ13214 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SEMA3BQ13214 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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