Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms