Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms