Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CDKN2AIPNLP3-201ENST00000418361 309 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079987.1-201ENST00000420181 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGQP1-201ENST00000426300 430 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DLEC1P1-201ENST00000427139 576 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512590.1-201ENST00000430691 821 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL709P-201ENST00000478855 300 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139887.2-203ENST00000503185 618 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016924.1-202ENST00000512435 447 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMM10-203ENST00000525587 486 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL110504.1-201ENST00000557733 889 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GSG1L-205ENST00000569166 585 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL220P-201ENST00000581978 300 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL823P-201ENST00000584886 295 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL377P-201ENST00000585039 278 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPY-205ENST00000591228 499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008738.2-201ENST00000593041 404 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPMP2-201ENST00000596369 599 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008878.1-202ENST00000599312 382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GAGE13-201ENST00000612958 530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF195-229ENST00000618467 440 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000553.4-201ENST00000641967 471 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC39A-201ENST00000262675 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-207ENST00000418951 5062 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA6-201ENST00000272203 7401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF7IP-221ENST00000543189 4887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA5-202ENST00000611914 3552 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAT-207ENST00000520214 4294 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF5-203ENST00000541430 4268 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CCSER1-209ENST00000509176 5847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFAP3-206ENST00000538366 3159 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DSCAML1-201ENST00000321322 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL3-202ENST00000368136 4235 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SELP-206ENST00000458599 1945 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms