Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TMIEQ8NEW7 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms