Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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