Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCAQ16586 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCAQ16586 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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