Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms