Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 APOL3-202ENST00000361710 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms