Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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