Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms