Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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HOXA2O43364 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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