Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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