Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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