Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092279.1-202ENST00000597683 1966 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A10P-201ENST00000530206 1395 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK10-201ENST00000331006 3344 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GAREM1-202ENST00000399218 7033 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMSAP2-203ENST00000413307 4498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGAE-201ENST00000263087 3858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC124319.2-201ENST00000575034 3651 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6C66P-203ENST00000641469 4627 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R5-209ENST00000581552 3253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MSRB3-201ENST00000308259 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011815.1-201ENST00000586922 4382 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GNG2-201ENST00000335281 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A3-201ENST00000298085 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP2-204ENST00000542807 3110 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL451165.1-201ENST00000334441 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TAC4-204ENST00000398154 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms