Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms