Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC010507.2-201ENST00000632795 676 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ARL6IP4-202ENST00000357866 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 IGLV3-1-201ENST00000390319 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC073091.1-201ENST00000398059 864 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL732414.1-201ENST00000413346 573 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CYP4F62P-201ENST00000417310 524 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PRAC1Q96KF2 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PRAC1Q96KF2 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MYL6P2-201ENST00000450079 434 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PRAC1Q96KF2 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PRAC1Q96KF2 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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PRAC1Q96KF2 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PRAC1Q96KF2 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC010457.1-202ENST00000510137 337 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RNA5SP159-201ENST00000517161 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC091980.1-201ENST00000524262 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC025030.1-201ENST00000548007 573 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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