Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC93Q567U6 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC93Q567U6 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC93Q567U6 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC93Q567U6 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC93Q567U6 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC93Q567U6 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms