Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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COL24A1Q17RW2 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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COL24A1Q17RW2 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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COL24A1Q17RW2 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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