Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms