Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ITGA9Q13797 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ITGA9Q13797 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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