Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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