Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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CLN3Q13286 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CLN3Q13286 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CLN3Q13286 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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