Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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