Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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