Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms