Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms