Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IRF9Q00978 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms