Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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