Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms