Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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