Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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