Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD42Q8N9B4 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms