Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms