Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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