Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms