Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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FOXF2Q12947 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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FOXF2Q12947 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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